Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5DQ9BY66 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5DQ9BY66 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms