Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGIP1Q9BQI5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGIP1Q9BQI5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms