Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEIS3Q99687 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIS3Q99687 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms