Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNBD2Q96M20 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms