Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTF1AQ7RTS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms