Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF7Q6Q0C0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms