Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54Q6NXT1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms