Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRIP1Q5VSL9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms