Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD1Q5SYB0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms