Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms