Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKDCCQ504Y2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKDCCQ504Y2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms