Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC85BQ15834 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC85BQ15834 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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