Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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