Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VGLL4Q14135 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms