Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ALCAMQ13740 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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