Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATMQ13315 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATMQ13315 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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