Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLN3Q13286 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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CLN3Q13286 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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CLN3Q13286 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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