Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3AQ05086 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms