Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP2BQ02880 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP2BQ02880 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms