Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms