Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDK17Q00537 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDK17Q00537 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms