Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK5Q00535 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK5Q00535 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms