Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPCS3P61009 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms