Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJA9P57773 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms