Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPS1P31327 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPS1P31327 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CPS1P31327 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPS1P31327 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPS1P31327 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CPS1P31327 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms