Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms