Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSFA2P28290 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms