Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRAP18433 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms