Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRFP10586 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRFP10586 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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