Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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