Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG7O95352 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms