Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRMUO75648 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRMUO75648 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms