Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP2O75323 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP2O75323 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms