Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP5O75197 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP5O75197 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP5O75197 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP5O75197 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms