Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCSER1Q9C0I3 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCSER1Q9C0I3 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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