Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TMX3Q96JJ7 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms