Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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ZBED3Q96IU2 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED3Q96IU2 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
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ZBED3Q96IU2 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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ZBED3Q96IU2 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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ZBED3Q96IU2 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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ZBED3Q96IU2 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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