Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CTXN3Q4LDR2 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms