Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CSPP1Q1MSJ5 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms