Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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