Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF239Q16600 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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