Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
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SGCBQ16585 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SGCBQ16585 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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