Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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