Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SIX1Q15475 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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