Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms