Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MDC1Q14676 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MDC1Q14676 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms