Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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SEMA3AQ14563 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3AQ14563 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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