Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KCNC3Q14003 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms