Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCINQ13939 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCINQ13939 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms