Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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